Sau năm 1954, xã Cẩm Vân thuộc huyện Cẩm Thủy.

Năm 1964, xã Cẩm Vân tách thành hai xã Cẩm Vân và Cẩm Yên. Xã Cẩm Vân sau khi chia tách gồm có 8 xóm: Tiên Lăng, Tường Yên, Quan Phác, Vân Trai, Cát Khánh, Vân Long, Quan Bằng và Cẩm Thành.[3].

Cuối năm 2018, xã Cẩm Vân có diện tích 17,39 km2, dân số là 7.734 người.

Ngày 16 tháng 10 năm 2019, sáp nhập toàn bộ 2,43 km2 và 994 người của thôn Phác Lê, xã Cẩm Vân vào xã Cẩm Tân. Xã Cẩm Vân còn lại 14,96 km2 diện tích và 6.740 người.[1]